1.Obszar Natura 2000 „Wisłok Środkowy z Dopływami” na Zalewie Rzeszowskim o powierzchni w granicach miasta wynoszącej 130 ha.
2.Obszar Natura 2000 „Mrowle Łąki” w północnej części gminy o powierzchni w granicach miasta wynoszącej 35 ha.
3.Rezerwat przyrody o charakterze leśnym „Lisia Góra” o powierzchni 8,11 ha usytuowany jest w południowej części miasta nad zachodnim brzegiem Zalewu Rzeszowskiego.
4.Pomniki przyrody
W granicach Rzeszowa znajdują się obecnie 93 pomniki przyrody ożywionej, na co składa się 87 pomników będących pojedynczymi drzewami oraz 6 pomników zbiorowych. Łącznie ochroną prawną objęto 115 drzew. Ewidencja pomników przyrody dostępna jest pod adresem: http://geoserwis.gdos.gov.pl/mapy/
5.Ochrona gatunkowa roślin.
Na terenie miasta występują następujące gatunki roślin objęte ochroną ścisłą lub częściową: Zimowit jesienny (w Parku Papieskim u zbiegu al. Armii Krajowej i al. Sikorskiego), Centuria pospolita (okolice Strugu), Kukułka szerokolistna (okolice ul. Dębickiej), Podkolan biały (rezerwat „Lisia Góra”).